ИНФОРМАЦИОННЫЙ ЛИСТОК РОССЕЛЬХОЗЦЕНТРА. Преимущества метода ПЦР диагностики

Прямое определение наличия возбудителей. Многие традиционные методы диагностики, например, иммуноферментный анализ, выявляют белки-маркеры, являющиеся продуктами жизнедеятельности инфекционных агентов, что дает лишь опосредованное свидетельство наличия инфекции. Выявление специфического участка ДНК возбудителя методом ПЦР дает прямое указание на присутствие возбудителя инфекции.

Высокая специфичность.   Высокая специфичность метода ПЦР обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется уникальный, характерный только для данного возбудителя фрагмент ДНК. Специфичность задается нуклеотидной последовательностью праймеров, что исключает возможность получения ложных результатов.

Высокая чувствительность. Метод ПЦР позволяет выявлять даже единичные клетки бактерий или вирусов. ПЦР анализ обнаруживает наличие возбудителей инфекционных заболеваний в тех случаях, когда другими методами это сделать невозможно.

Универсальность процедуры выявления различных возбудителей. Материалом для исследования методом ПЦР служит ДНК возбудителя. Метод основан на выявлении фрагмента ДНК или РНК, являющегося специфичным для конкретного организма. Сходство химического состава всех нуклеиновых кислот позволяет применять унифицированные методы проведения лабораторных исследований. Это дает возможность диагностировать несколько возбудителей из одной биопробы.

Высокая скорость получения результата анализа.  Для проведения ПЦР анализа не требуется выделение и выращивание культуры возбудителя, что занимает большое количество времени. Унифицированный метод обработки биоматериала и детекции продуктов реакции и автоматизация процесса амплификации дают возможность провести полный анализ за 4-5 часов.

Что можно определить методом ПЦР диагностики:

Патогены картофеля (ДНК):

• кольцевая гниль картофеля (Clavibacter michiganensis subsp/ sepedonicum)
• черная ножка (Pectobacterium atrocepticum, Dickea dianthicola, Erwinia carotovora subsp. Atroseptica) 
• бурая гниль (Ralstonia solanacearum)
• фитофтороз (Phytophthora infestans)

Патогены картофеля (РНК):

• Вирус А (PVA)
• Вирус М (PVM)
• Вирус S (PVS)
• Вирус Х (PVX)
• Вирус Y  (PVY)
• Вирус скручивания листьев (PLRV)
• Вирус метельчатости верхушки картофеля  (PMTV)
• Вироид веретеновидности клубней картофеля  (PSTVd)

В каких случаях возможно проведение анализа:

• первичное семеноводство, на всех этапах размножения семян;
• при закупке семян, чтобы убедиться в качестве закупаемых семян;
• при проведении апробации посадок картофеля, для получения более достоверных результатов.

Ранняя диагностика патогенов картофеля – одно из ключевых условий снижения потерь урожая, поскольку позволяет своевременно предпринимать необходимые меры по его защите. Особенно это важно в случае бактериальных и вирусных инфекций, поскольку, в силу их биологических особенностей, растение после заражения уже невозможно вылечить. Своевременное выявление таких патогенов в семенном картофеле позволяет отбраковать зараженные клубни и избежать появления и распространения инфекции в поле. Не менее важна диагностика болезней растений – благодаря ей можно вовремя принимать меры по уничтожению переносчиков инфекции, выбраковке пораженного картофеля, закрытию поля на карантин и т. п.